2003年6月10日，通過阿壩州第九屆人民政府研究決定：同意保留馬爾康民族師范學校雙語師資培訓功能的基礎上創辦阿壩州民族高級中學，實行“一套班子，兩塊牌子”兩種功能并存的學校，學校確立了以“規模求效益，質量求生存，特色求發展”的學校建設思路；高舉民族教育大旗，走“質量興校，特色強校”的奮進之路，努力實現“雙語”教育與現代化教育接軌的目標，把“創建全國藏區一流學校”作為我校的發展目標而努力奮斗。

學校擁有全州一流可容納萬余人涵蓋國際標準的大型田徑場以及標準籃球場，有多功能學生食堂禮堂綜合大樓等基礎設施。近年來學校極力籌措資金，投資1700多萬元新建了寬敞明亮生活設施配套齊全的學生公寓和具有標準的理化生實驗室、計算機網絡教室和多媒體教室的現代教學實驗綜合樓，極大地改善了辦學條件。學校現有教職工140人，其中專職教師102人，省州以上優秀教師 13人。現有29個教學班，全校寄宿制學生達1500余人。

學校辦學歷史長，成績卓著，躋身于國家教委聯合國兒童基金會師資培訓合作項目學校，四川省首批辦好的十九所重點師范學校之一，被省教育廳授予“雙語教學先進集體”。2004年，學校成為阿壩州教師信息技術教育測試點和四川省體育傳統項目示范學校。 2005年，學校被阿壩州委、州人民政府命名為2004年度州級文明單位和阿壩州五四紅旗團委，成為四川省農村中小學現代遠程教育工程“項目學校”。成為青海師范大學西北民族大學等高等學校的實習基地。學校在2006年中國西部教育改革與發展高端論壇上被評為“中國西部名校”稱號。2007年3月15日，四川質量報社授予我校3.15強教育、樹校風、無投訴“AAA級示范學校”榮譽稱號。